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质谱

ESI-MS 确认 该分子与合成声明一致。

正模式电喷雾电离,实测分子量与理论序列匹配偏差在 ±1 Da 以内。这是 HPLC 无法替代的检测——也是截短体和加合物无法隐藏的检测。

±1 Da分子量容差
ESI+电离模式
100%已验证批次
端到端工作流程

从样品等分到身份确认的六个步骤。

质谱是一种确证性检测——它回答 HPLC 无法回答的问题。通过色谱纯度下限的同一批次在签署放行前经过此流程。

  1. 01

    分装与稀释

    HPLC 所用同一样品取 20 µg,用 50:50 乙腈/水 + 0.1% 甲酸稀释至 5 µg/mL 工作浓度——此为稳定电喷雾且不使离子源过载的最佳浓度。

    ≈ 0.2 h · 5 µg/mL 准备
  2. 02

    校准检查

    仪器针对多肽参考物质(碘化铯簇离子或序列标准品)进行校准,全扫描范围内 m/z 准确度经验证 < 5 ppm。不得在漂移仪器上运行样品。

    预运行 · < 5 ppm 漂移
  3. 03

    直接注射(或 LC-MS)

    样品装入玻璃注射器,以 5 µL/min 通过 ESI 离子源注射。对于复杂样品,使用在线 HPLC 色谱柱在质谱兼容流动相(甲酸替代 TFA)中进行在线脱盐。

    ≈ 0.3 h · 5 µL/min 注射
  4. 04

    全扫描采集

    正模式电喷雾,毛细管 4.0 kV,离子源 150 °C,锥孔 40 V。扫描范围 m/z 100–3000,1 谱/秒,平均 60 秒以确保信号稳定性和同位素包络清晰度。

    ≈ 1 min · 扫描平均
  5. 05

    电荷态去卷积

    多电荷峰(9 kDa 多肽通常为 [M+4H]<sup>4+</sup> 至 [M+12H]<sup>12+</sup>)通过最大熵算法去卷积为单一中性分子量。输出:一个具有同位素分辨精度的分子量值。

    自动化 · MaxEnt 算法
  6. 06

    身份判定

    实测分子量与从序列计算的理论分子量比较。偏差 ≤ ±1 Da:身份确认,批次进入 LAL 内毒素检测。更大偏差:批次保留,合成批次接受调查。

    质控人员 · 已签署
质谱图解析

多电荷包络,去卷积为单一数值。

电喷雾产生同一分子的一系列多质子化离子。包络的模式本身即为确认:干净、可预测的分布意味着单一确定的物质。以下是解读的要点。

ESI-MS · IGF-1 LR3 · Lot LR3-2025-A47 · 正模式 去卷积分子量 · 9111.2 Da
50010001500200025003000 m/z

电荷包络

八种质子化态从 <b>[M+12H]<sup>12+</sup></b> 到 <b>[M+4H]<sup>4+</sup></b>,分布于干净的高斯包络中。包络形状本身即可确认单一确定的分子;嵌合体或污染物将导致其变形。

去卷积分子量

最大熵算法将多电荷包络还原为单一中性质量:<b>9111.2 Da</b>。理论值:9111.5 Da。Δ = <b>−0.3 Da</b>——完全在 ±1 Da 放行窗口内。

基线

电荷态之间平坦,无寄生离子,无 Na<sup>+</sup>/K<sup>+</sup> 加合物阶梯,无早洗脱基质干扰。最强峰的信噪比超过 200:1。

方法参数

离子源、分析器、扫描、校准。

没有披露参数的质谱只是一个带印章的数字。以下是实验室运行的精确条件——可在任何现代 Q-TOF 或 Orbitrap 级仪器上重现。

电离源

模式电喷雾,正模式(ESI+)
毛细管电压4.0 kV
锥孔电压40 V
离子源温度150 °C
去溶剂气N₂, 800 L/h, 350 °C
流速5 µL/min(直接注射)

质量分析器

类型Q-TOF,高分辨率
分辨率≥ 25 000 FWHM
质量准确度< 5 ppm RMS
扫描范围m/z 100 – 3000
扫描速率1 spectrum/sec
采集60 s,信号平均

校准与质量控制

校准品甲酸钠簇离子
频次每日锁定质量 + 每批次核验
漂移拒绝> 5 ppm = 不允许进样
系统适用性参考多肽,m/z 和强度
重复每批次采集 2 次
参考标准品独立,批次可溯源

样品与处理

稀释剂50:50 ACN/H₂O + 0.1% formic acid
浓度5 µg/mL 工作液
已处理电荷态+4 至 +12(典型范围)
去卷积MaxEnt,贝叶斯模型
输出质量容差± 0.1 Da resolved
报告Δ 相对理论分子量,单位 Da
质量准确度等级

分子量偏差实际上意味着什么。

多肽就是其序列;序列具有确定的质量。实测分子量与理论分子量之间的偏差是一个信号——有时可忽略不计,有时则意味着合成失败。以下是我们解读这一偏差的方式。

< 0.5 Da典型 IGF1 Shop 放行
等效 ppm(9 kDa)< 55 ppm
它意味着什么身份已确认

我们批次实际落点所在范围。在同位素包络精度内——分子与序列逐原子匹配。

0.5 – 1.0 Da放行上限
等效 ppm(9 kDa)55 – 110 ppm
它意味着什么合格,无标记

在 ±1 Da 放行窗口内。可能是大分子多肽的校准噪声;序列完整性完好。

1 – 5 Da调查
等效 ppm(9 kDa)110 – 550 ppm
它意味着什么重新采集,重新校准

在放行窗口之外,但在常见修饰质量范围内。在新校准的仪器上重新运行;如确认,批次保留。

> 5 Da拒绝
等效 ppm(9 kDa)> 550 ppm
它意味着什么错误分子

序列错误、缺失残基、重大修饰或标签错误。立即拒绝并调查合成批次。

解读次级峰

谱图中每个质量位移意味着什么。

就像 HPLC 通过保留时间位移讲述故事一样,ESI-MS 通过质量位移讲述故事。相同的次级峰在多次合成中重复出现——每个都指向特定的失败模式。

质量位移修饰可能原因操作
+ 16 Da 甲硫氨酸/色氨酸氧化 纯化过程中的空气暴露 可接受 < 0.5%
+ 1 Da Asn / Gln 脱酰胺 老化样品,碱性条件 调查 > 0.3%
+ 22 Da 钠加合物 [M+Na]<sup>+</sup> 盐污染,玻璃器具 化妆品 < 1%
+ 38 Da 钾加合物 [M+K]<sup>+</sup> 盐污染 化妆品 < 1%
+ 114 Da TFA 加合物 HPLC 残余离子对试剂 化妆品 < 0.5%
− 残基质量 截短体/缺失 合成过程中的偶联失败 拒绝 > 0.5%
+ 残基质量 插入/双偶联 副反应,污染试剂 拒绝 > 0.3%
≈ 2× MW 二聚体(共价或非共价) 二硫键,聚集 拒绝 > 1%
硬性失败

四种拒绝身份鉴别的情况。

HPLC 纯度超过 99% 并不能使批次免于质谱拒绝。以下是质控人员签署质谱拒绝通知的情况——与色谱结果无关。

F1

去卷积分子量偏差 > ±1 Da

放行窗口。读数为 9113 而非 9111.5 的 9 kDa 多肽并非"足够接近"——这是与脱酰胺一致的 +1.5 Da 位移,批次保留直至确定位移来源。

F2

次级物质 > 主峰的 1%

去卷积谱图中 ≥ 1% 主分子量信号的杂质峰表明存在 HPLC 无法分离的修饰或截短体。无论 HPLC 纯度如何,该批次均需进行调查。

F3

电荷包络失真

如多电荷分布非高斯分布——预期电荷态出现空缺、不对称拖尾、多个包络重叠——则样品含有多种物质,无法报告身份鉴别结果。

F4

校准漂移 > 5 ppm

每批次前以甲酸钠梯级离子验证校准。若扫描范围内质量准确度的均方根超过 5 ppm,则在重新校准仪器之前不得采集客户样品。

常见问题

研究人员关于质谱验证的问题。

为什么使用 ESI 而非 MALDI?
MALDI(基质辅助激光解吸/电离)速度更快,对较脏样品的耐受性更好,但主要产生单电荷离子——这限制了可用质量范围并使去卷积噪声更大。ESI 产生支持 MaxEnt 去卷积的多电荷包络,对约 30 kDa 以内的多肽可达到单 Da 精度。对于我们的目录,ESI 是更好的选择。
为什么使用 ±1 Da 而非百万分之一精度?
ppm 准确度描述仪器性能;±1 Da 是*生物学*阈值。1 Da 的位移可区分完整多肽和脱酰胺异构体——正是对身份鉴别至关重要的那类误差。我们在内部以 ppm 报告质量准确度(目标 < 5 ppm),并在 COA 上转换为 ±1 Da 以使数值保持可解读性。
同位素包络和单同位素质量呢?
对于 5 kDa 以下的多肽,我们报告单同位素质量(最低质量同位素体);对于 5 kDa 以上同位素无法分辨的多肽,我们报告由自然丰度计算的平均质量。COA 始终注明使用的约定方式,以使与理论值的比较无歧义。
质谱确认的是序列还是仅确认分子量?
标准 ESI-MS 扫描仅确认分子量。如需序列级确认,我们可按需运行 MS/MS(碰撞诱导解离,将多肽碎裂为 b 和 y 离子并读取残基梯度)——机构买家可按需申请,或当放行样品触发调查时自动执行。
质谱能检测糖基化、PEG 化或脂化吗?
是——这些都会产生确定的质量位移(每己糖 162 Da,PEG 每氧化乙烯 44 Da 等),表现为主峰位移或次级物质。我们在 COA 的"观察"行中标记任何与已知修饰一致的意外质量位移。
为什么不直接相信合成设施的内部质谱?
出于同样原因我们不信任其 HPLC:为自己产品签字的实验室无法发现自身的系统性错误。独立合同实验室使用不同仪器、不同校准历史、不同操作员——而这种独立性正是 COA 的全部意义所在。