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Massenspektrometrie

ESI-MS bestätigt das Molekül ist das, was die Synthese behauptet.

Elektrosprayionisierung im positiven Modus, beobachtetes Molekulargewicht mit der theoretischen Sequenz innerhalb von ±1 Da abgeglichen. Der Test, den HPLC nicht ersetzen kann — und vor dem Verkürzungen und Addukte sich nicht verstecken können.

±1 DaMW-Toleranz
ESI+Ionisierungsmodus
100%Verifizierte Chargen
Ende-zu-Ende-Workflow

Sechs Schritte vom Proben-Aliquot zur bestätigten Identität.

Massenspektrometrie ist ein Bestätigungsassay — sie beantwortet eine Frage, die HPLC nicht kann. Dieselbe Charge, die den chromatographischen Reinheitsboden bestanden hat, durchläuft diesen Weg, bevor die Freigabe unterzeichnet wird.

  1. 01

    Aliquotierung & Verdünnung

    20 µg derselben per HPLC analysierten Probe werden in 50:50 Acetonitril/Wasser + 0,1 % Ameisensäure auf eine Arbeitskonzentration von 5 µg/mL verdünnt — der optimale Punkt für stabiles Elektrospray ohne Quellenüberlastung.

    ≈ 0,2 Std. · 5 µg/mL Vorbereitung
  2. 02

    Kalibrierungscheck

    Instrument kalibriert gegen eine Polypeptid-Referenz (Cäsiumiodid-Clusterionen oder einen sequenzierten Standard), m/z-Genauigkeit über den gesamten Scanbereich bei < 5 ppm verifiziert. Keine Probe wird auf einem gedrifteten Instrument ausgeführt.

    Vorlauf · < 5 ppm Drift
  3. 03

    Direktinfusion (oder LC-MS)

    Probe in eine Glasspritze geladen und mit 5 µL/min durch die ESI-Quelle infundiert. Für komplexe Proben wird eine In-line-HPLC-Säule in MS-kompatibler Mobilphase (Ameisensäure ersetzt TFA) zur Inline-Entsalzung verwendet.

    ≈ 0,3 Std. · 5 µL/min Infusion
  4. 04

    Vollscan-Erfassung

    Positives Elektrospray, Kapillare 4,0 kV, Quelle 150 °C, Konus 40 V. Scanbereich m/z 100–3000 bei 1 Spektrum/Sek., über 60 Sekunden für Signalstabilität und Isotopenhüllenklarheit gemittelt.

    ≈ 1 min · Scan gemittelt
  5. 05

    Ladungszustand-Dekonvolution

    Mehrfach geladene Peaks (typischerweise [M+4H]<sup>4+</sup> bis [M+12H]<sup>12+</sup> für ein 9-kDa-Peptid) werden durch Maximum-Entropie-Algorithmus zu einem einzigen neutralen Molekulargewicht dekonvolviert. Output: ein MW-Wert mit isotopenaufgelöster Präzision.

    automatisiert · MaxEnt
  6. 06

    Identitätsentscheidung

    Beobachtetes MW verglichen mit dem aus der Sequenz berechneten theoretischen MW. ≤ ±1 Da Abweichung: Identität bestätigt, die Charge geht zum LAL-Endotoxin-Test. Größere Abweichung: Charge wird zurückgehalten und die Synthesecharge untersucht.

    QC-Beauftragter · unterzeichnet
Anatomie eines Massenspektrums

Eine Mehrfachladungshülle, auf eine Zahl dekonvolviert.

Elektrospray erzeugt eine Reihe mehrfach protonierter Ionen desselben Moleküls. Das Muster der Hülle ist selbst eine Bestätigung: Eine saubere, vorhersagbare Verteilung bedeutet eine einzelne definierte Spezies. Folgendes liest man darin.

ESI-MS · IGF-1 LR3 · Lot LR3-2025-A47 · positiver Modus Dekonvolviertes MW · 9111.2 Da
50010001500200025003000 m/z

Ladungshülle

Acht Protonierungszustände von <b>[M+12H]<sup>12+</sup></b> bis <b>[M+4H]<sup>4+</sup></b>, in einer sauberen Gauß-Hülle verteilt. Die Form selbst bestätigt ein einzelnes definiertes Molekül; eine Chimäre oder Kontamination würde sie verzerren.

Dekonvolviertes MW

Maximum-Entropie-Algorithmus reduziert die Mehrfachladungshülle auf eine neutrale Masse: <b>9111,2 Da</b>. Theoretisch: 9111,5 Da. Δ = <b>−0,3 Da</b> — weit innerhalb des ±1 Da-Freigabefensters.

Basislinie

Flach zwischen Ladungszuständen, keine parasitären Ionen, keine Na<sup>+</sup>/K<sup>+</sup>-Adduktleitern, keine früh eluierende Matrixinterferenz. Das Signal-Rausch-Verhältnis des häufigsten Peaks übersteigt 200:1.

Methodenparameter

Quelle, Analysator, Scan, Kalibrierung.

Massenspektrometrie ohne offengelegte Parameter ist nur eine Zahl mit einem Stempel. Hier ist genau das, womit das Labor läuft — reproduzierbar auf jedem modernen Q-TOF- oder Orbitrap-Klasse-Instrument.

Ionisierungsquelle

ModusElektrospray, positiv (ESI+)
Kapillarspannung4.0 kV
Konusspannung40 V
Quellentemperatur150 °C
DesolvationsgasN₂, 800 L/h, 350 °C
Flussrate5 µL/min (Direktinfusion)

Massenanalysator

TypQ-TOF, hohe Auflösung
Auflösung≥ 25 000 FWHM
Massengenauigkeit< 5 ppm RMS
Scanbereichm/z 100 – 3000
Scanrate1 spectrum/sec
Messung60 s, signalgemittelt

Kalibrierung & QC

KalibrantNatriumformiat-Clusterionen
TaktTägliche Sperrmassen + chargenweise Überprüfung
Driftablehnung> 5 ppm = kein Lauf
SystemeignungReferenzpeptid, m/z und Intensität
Replikate2 Messungen pro Charge
ReferenzstandardUnabhängig, chargenrückverfolgbar

Probe & Verarbeitung

Verdünnungsmittel50:50 ACN/H₂O + 0.1% formic acid
Konzentration5 µg/mL Arbeitslösung
Verarbeitete Ladungszustände+4 bis +12 typisch
DekonvolutionMaxEnt, Bayes'sches Modell
Ausgabe-Massentoleranz± 0.1 Da resolved
BerichterstattungΔ vs. theoretisches MW, in Da
Massengenauigkeitsstufen

Was eine MW-Abweichung tatsächlich bedeutet.

Ein Peptid ist seine Sequenz; eine Sequenz hat eine definierte Masse. Eine Abweichung zwischen beobachtetem und theoretischem MW ist ein Signal — manchmal vernachlässigbar, manchmal ein Synthesefehler. So lesen wir es.

< 0.5 Datypische IGF1 Shop-Freigabe
Äquivalente ppm (9 kDa)< 55 ppm
Was es bedeutetIdentität bestätigt

Wo die meisten unserer Chargen tatsächlich landen. Innerhalb der Isotopenhüllen-Präzision — das Molekül entspricht der Sequenz Atom für Atom.

0.5 – 1.0 DaFreigabeobergrenze
Äquivalente ppm (9 kDa)55 – 110 ppm
Was es bedeutetAkzeptabel, keine Markierung

Innerhalb des ±1 Da-Freigabefensters. Wahrscheinlich Kalibrierungsrauschen bei einem großen Peptid; Sequenzintegrität ist intakt.

1 – 5 Dauntersuchen
Äquivalente ppm (9 kDa)110 – 550 ppm
Was es bedeutetErneut erfassen, rekalibrieren

Außerhalb des Freigabefensters, aber innerhalb gängiger Modifikationsmassen. Auf einem frisch kalibrierten Instrument erneut ausführen; wenn bestätigt, wird die Charge zurückgehalten.

> 5 Daablehnen
Äquivalente ppm (9 kDa)> 550 ppm
Was es bedeutetFalsches Molekül

Sequenzfehler, fehlender Rest, grobe Modifikation oder falsches Etikett auf dem Fläschchen. Sofort abgelehnt und die Synthesecharge untersucht.

Die Sekundärpeaks lesen

Was jede Massenverschiebung im Spektrum bedeutet.

Genau wie HPLC eine Geschichte in Retentionsverschiebungen erzählt, erzählt ESI-MS eine in Massenverschiebungen. Dieselben Sekundärpeaks wiederholen sich über Synthesen hinweg — und jeder zeigt auf eine bestimmte Versagensart.

MassenverschiebungModifikationWahrscheinliche UrsacheMaßnahme
+ 16 Da Methionin / Trp-Oxidation Luftkontakt während der Reinigung Akzeptabel < 0,5 %
+ 1 Da Asn / Gln Desaminierung Gealterte Probe, basische Bedingungen Untersuchen > 0,3 %
+ 22 Da Natriumaddukt [M+Na]<sup>+</sup> Salzkontamination, Glasgeschirr Kosmetisch < 1 %
+ 38 Da Kaliumaddukt [M+K]<sup>+</sup> Salzkontamination Kosmetisch < 1 %
+ 114 Da TFA-Addukt Restliches Ionenpaarungsreagenz aus HPLC Kosmetisch < 0,5 %
− Restmasse Verkürzung / Deletion Kupplungsversagen während der Synthese Ablehnen > 0,5 %
+ Restmasse Einfügung / Doppelkupplung Nebenreaktion, kontaminiertes Reagenz Ablehnen > 0,3 %
≈ 2× MW Dimer (kovalent oder nicht-kovalent) Disulfidbindung, Aggregation Ablehnen > 1 %
Harte Versagensfälle

Vier Bedingungen, die die Identität ablehnen.

HPLC-Reinheit über 99 % rettet eine Charge nicht vor MS-Ablehnung. Dies sind die Bedingungen, unter denen der QC-Beauftragte eine MS-Ablehnung unterzeichnet — unabhängig vom chromatographischen Ergebnis.

F1

Dekonvolvierte MW-Abweichung > ±1 Da

Das Freigabefenster. Ein 9-kDa-Peptid, das 9113 statt 9111,5 anzeigt, ist nicht „nah genug" — es ist eine +1,5 Da-Verschiebung, die mit Desaminierung konsistent ist, und die Charge wird zurückgehalten, bis die Quelle der Verschiebung identifiziert ist.

F2

Sekundäre Spezies > 1 % des Hauptpeaks

Ein Verunreinigungspeak im dekonvolvierten Spektrum bei ≥ 1 % des Haupt-MW-Signals zeigt eine Modifikation oder Verkürzung an, die HPLC nicht trennen konnte. Die Charge wird unabhängig von der HPLC-Reinheit untersucht.

F3

Ladungshüllenverzerrung

Wenn die Mehrfachladungsverteilung nicht Gauß-förmig ist — Lücken in den erwarteten Ladungszuständen, asymmetrischer Schwanz, mehrere sich überlappende Hüllen — enthält die Probe mehr als eine Spezies und die Identität kann nicht gemeldet werden.

F4

Kalibrierungsdrift > 5 ppm

Die Kalibrierung wird vor jeder Charge gegen eine Natriumformiatleiter verifiziert. Wenn die Massengenauigkeit über den Scanbereich 5 ppm RMS überschreitet, wird keine Kundenprobe erfasst, bis das Instrument neu kalibriert ist.

FAQ

Was Forscher über MS-Verifikation fragen.

Warum ESI und nicht MALDI?
MALDI (Matrix-assistierte Laser-Desorption/Ionisierung) ist schneller und toleriert unsauberere Proben, erzeugt aber überwiegend einfach geladene Ionen — was den nutzbaren Massenbereich begrenzt und die Dekonvolution rauschiger macht. ESI erzeugt eine Mehrfachladungshülle, die MaxEnt-Dekonvolution bis auf Da-Präzision für Peptide bis ~30 kDa unterstützt. Für unseren Katalog ist ESI der bessere Kompromiss.
Warum ±1 Da und nicht Parts-per-Million-Genauigkeit?
PPM-Genauigkeit beschreibt das Instrument; ±1 Da ist der *biologische* Schwellenwert. Ein 1-Da-Shift unterscheidet zwischen intaktem Peptid und desaminieren Isoformen — genau die Art von Fehler, der für die Identität relevant ist. Wir berichten die Massengenauigkeit intern in ppm (Ziel < 5 ppm) und übersetzen sie auf dem COA in ±1 Da, damit die Zahl interpretierbar bleibt.
Was ist mit Isotopenhülle und monoisotopischer Masse?
Für Peptide unter 5 kDa berichten wir die monoisotopische Masse (niedrigste Massenisotopologe); für Peptide über 5 kDa, wo Isotope nicht aufgelöst werden, berichten wir die aus natürlicher Häufigkeit berechnete Durchschnittsmasse. Das COA gibt immer an, welche Konvention verwendet wird, damit der Vergleich mit der theoretischen Masse eindeutig ist.
Bestätigt MS die Sequenz oder nur das Molekulargewicht?
Ein Standard-ESI-MS-Scan bestätigt nur den MW. Zur Sequenzbestätigung führen wir auf Anfrage MS/MS durch (kollisionsinduzierte Dissoziation, Fragmentierung des Peptids in b- und y-Ionen und Ablesen der Restleiter) — auf Anfrage für institutionelle Käufer inbegriffen oder wenn eine Freigabeprobe eine Untersuchung auslöst.
Kann MS Glykation, PEGylierung oder Lipidierung erkennen?
Ja — diese erzeugen alle definierte Massenverschiebungen (162 Da pro Hexose, 44 Da pro Ethylenoxid für PEG usw.), die entweder als verschobener Hauptpeak oder als sekundäre Spezies erscheinen. Wir markieren jede unerwartete Massenverschiebung, die mit einer bekannten Modifikation auf der „Beobachtungen"-Zeile des COA übereinstimmt.
Warum nicht einfach der hauseigenen MS der Syntheseanlage vertrauen?
Aus demselben Grund, warum wir ihrer HPLC nicht vertrauen: Ein Labor, das sein eigenes Produkt abzeichnet, kann seine eigenen systematischen Fehler nicht erkennen. Das unabhängige Vertragslabor verwendet andere Instrumente, eine andere Kalibrierungsgeschichte, andere Bediener — und diese Unabhängigkeit ist der gesamte Sinn des COA.